当代医药商业性联盟运动最早可追溯到上个世纪中后期的上海医药股份及华氏大药房成立的“销地联合批发公司”和“合资药店”。本世纪初，一些区域强势国有商业公司主张区域市场的相互渗透（包括相互委托招标、品种互换、市场营销资源共享等）和抵制价格竞争等，在全国范围内相继成立医药商业联盟。
自2008年10月份新医改征求意见稿公布以来，国内医药商业性联盟风起云涌，以各种形式和名义响应或规避新医改政策所带来的机会或风险的各种联盟，蔚为大观却又良莠不齐，构成了鱼龙混杂、泥沙俱下的医药商业联盟现状。
规模不大竞争不足
目前各式联盟层出不穷，但都普遍规模不大，核心竞争力不足，成了其发展的硬伤。究其原因，内部管理机制乃为主因。
联盟是指2个或2个以上的企业或组织，因为某种目的而以某种形式联合起来的虚拟组织。目前医药市场上的各种联盟，指称混乱，如果站在流通企业特别是零售企业的角度（工业企业之间的联盟暂且排除在外），可统归为商业性联盟，再根据组织形态和相互关系两个纬度，可把目前医药商业性联盟分为供零联盟、商商联盟、商零联盟、零零联盟四种类型。如下图所示：
供零联盟，是目前医药商业性联盟最基础、最广泛的联盟，同时它也是商业性联盟发展的背景。这类联盟可分为现款交易、代理、营销、品牌、OEM等五种最常见的最广泛的联盟形式以及以新技术、虚拟组织、资产关联等形式形成的新兴联盟体。在目前的产业竞争环境下，形式多样的供零联盟在品牌、价格与效率之间开展着激烈的竞争。
商商联盟，主要指商业批发公司之间的联盟。商业公司之间的纵向联盟（甚至包括一些大型公司内部的层级调拨），这些年来进展顺利，但横向联盟却乏善可陈（2005年的五大国有商业公司的商业经济联盟成立不久即宣告失败就是一个佐证）。但在新医改背景下，一些区域内中小型商业公司为争取招标配送资格而争相成立商商联盟，则预示了这类联盟体今后的方向，如2009年8月嘉兴医药商业联盟和11月浙江社区医药共同体的成立，以及早些时候，广东深圳中康福所呼吁的代理配送一体化的商商联盟体。
商零联盟，以2004年成立的广东思明公司为盟主的金百合药店联盟体为代表，2008年成立的浙江药通深度分销联盟，以及最近挂牌的四川大蓉合联盟，融入科伦后的PTO等，都可以视为商零联盟的典范。
零零联盟，以特格尔、江苏联盟等为代表，最近也有一些新的动向，如除了在联盟体内售卖贴牌产品外，也开始共同开店，进行资产层面的联合等。
